Ninja Kaplumbağalar ile tehlikeli karanlık dünyanın içerisine giriyor ve karşınıza çıkan engelleri aşıp,düşmanları yok ederek yolunuza devam etmeye çalışıyorsunuz.Leonardo,Michelangelo,Donatello ve Raphael karakterinden birini seçerek oyuna başlıyorsun.