Oyunun yüklenmek işlemi tamamlandıktan sonra karşına gelen giriş ekranındaki Select Combat System başlıklı sayfadan oyunun savaş türünü seçmelisin. Classical veya NXT Action olmak üzere iki farklı mücadele modu bulunan oyunda seçimini yaptıktan sonra kahramanımız Ash’i yönlendirmeye başlayabilirsin. Klavyendeki W,A,S,D veya yön tuşları ile hareket ettirebileceğin karakterin sahip olduğu pokemonları ve pokemonların bilgilerini oyun ekranının sol tarafında görebilirsin. Pokemonların arasında seçim yapmak için klavyendeki 1,2,3,...,6 gibi sayı tuşlarını kullanabilirsin. Seçtiğin pokemonu serbest bırakmak için ise Enter tuşuna basman gerekiyor. Serbest bıraktığın pokemonu kontrolünü de senin sağlayacağın oyunda etraftaki diğer pokemonlardan birisine saldırmak için 1 ve 2 tuşlarını kullanmalısın. Orjinal adı ile aynı olan Pokemon 3d oyununda iyi eğlenceler dileriz..